医院拥有大批先进医疗设备，如德国西门子1.5T超导核磁共振机、16排螺旋CT、西门子数字C臂血管造影机（DSA）、1000毫安数字胃肠机、数字DR拍片机、钴-60放疗机、全自动呼吸机、人工肝、血液净化机、高压氧舱、全自动麻醉机、美国全自动生化仪、超细电子胃镜、结肠镜、电子气管镜、三维彩超等，医疗设备达到厦门乃至省内三级医院先进水平。
