南宋末，黄粤南由新会来化龙镇定居，其子黄龙在村南建龙山寺，自任住持。死后，乡人传说他化龙归天，故村名为化龙。后逐渐发展为圩市，但规模小于西邻的新造圩，故又名细圩。清代，镇境分属茭塘都的化龙堡和明经堡。民国时分属深水社乡和岗尾社乡。建国初期属禺南东区。1957年3月为化龙、明经两大乡。1958年1月，明经并入化龙大乡。同年10月，属石楼团。1959年4月，从石楼析出为化龙公社。1962年1月至1963年1月，曾一度析出明经以南地区为明经公社。1984年为化龙区。1987年为化龙镇，辖13个行政村，26个自然村，2个居民委员会。
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