1999年10月，仁济东院建成投入使用。上海仁济医院现有核定床位1000张，在编职工2300余人，设有行政职能部门11个、临床科室29个、医技科室6个、市级研究所3个（消化疾病、风湿疾病、男性疾病）、其他各类医学研究室（中心）14个、临床诊疗中心18个。医院拥有立体定向下微电极刺激仪（细胞刀）、核磁共振仪（MRI）、多层螺旋CT（MSCT）、数字X线摄片机（DR）、PET－CT肿瘤放疗设备、数字减影心血管造影系统（DSA）、单光子发射计算机断层检查仪（SPECT）、彩色Doppler诊断仪、大型生化分析仪等先进的大型医疗设备。
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